Биоинформатика

Кажется, в наше время строгая типология наук просто перестала существовать — стираются границы между химией, физикой, информатикой, математикой, биологией и медициной. Об этих удивительных метаморфозах мы поговорили с профессором РАН, заведующим лабораторией трансляционной геномной биоинформатики МФТИ Антоном Буздиным. 

Анализируя этот набор данных и объединяя его с другими, можно будет найти ключевые гены, участвующие в путях проникновения вируса.

С момента расшифровки генома человека появились области биологии, изучающие данные, связанные с генетической информацией и ее реализацией на различных уровнях. В организме генетическая информация хранится в виде ДНК, и весь этот массив размером в 3 миллиарда пар нуклеотидов делится на участки — гены. Для передачи информации от конкретного гена и для последующего синтеза белка в качестве посредника используются молекулы РНК. Совокупность всех генов называется геномом. Полный набор РНК клетки — транскриптом (так как процесс синтеза РНК на матрице ДНК называется транскрипцией), а весь состав белков, характерный в конкретный момент для клетки, — протеом.

Анализ генома — задача биоинформатическая. Это большой массив данных — Big data, здесь вступают в работу математика, статистика, нейросети и методы машинного обучения. Таким образом, огромный базис Физтеха в области Computer science нашел свое практическое применение в одном из самых перспективных направлений науки — геномной инженерии.

Машинное обучение поможет вырастить сетчатку глаза.

С помощью полуавтоматического метода анализа ученые проанализировали 125 тысяч молекул.

Ученые предложили алгоритм, позволяющий быстрее и точнее исследовать ДНК.