Родился 29 августа 1967 года в Москве. Окончил факультет аэрофизики и космических исследований МФТИ в 1990 году. Тогда же начал работать в Институте космических исследований РАН (ИКИ РАН), с 2018 года возглавляет ИКИ РАН.
В 2025 году избран академиком РАН.

Главные научные достижения академика Анатолия Петруковича:
- определил динамику токовых слоев — важного элемента структуры бесстолкновительной плазмы: обнаружил и объяснил феномен сдвиговой неустойчивости слоя и построил новую модель разрушения слоя в ходе цикла накопления энергии;
- разработал модель зондовых измерений переменных электрических токов в околоземной плазме; модель применяется в анализе дисперсии плазменных волн вблизи околоземной ударной волны;
- открыл и изучил ряд новых глобальных эффектов и структур в магнитосфере Земли;
- разработал ряд оригинальных методов прогноза геомагнитной активности.
Анатолий Петрукович — о науке и ее практических выходах: «Мы в проекте „Спектр-РГ” ищем свидетельства того, какой наша Вселенная была раньше,— ведь это ключ к новым физическим законам, которых мы пока не знаем или не можем понять. Смотрите: вот смартфон. Он — дитя физики столетней давности: в нем объединены электричество и магнетизм (это Максвелл, середина XIX века), атомная физика и даже теория относительности, которым тоже уже по веку. Они соединились в практическом объекте через 100 лет. А мы сейчас ищем ту новую физику, которая соединится в практических объектах спустя еще век».
Проект к 80-летию Физтеха. Академики АН СССР и РАН — выпускники МФТИ.
