Родился 22 октября 1934 года в Краснодаре. Выпускник радиофизического факультета МФТИ (ныне факультет общей и прикладной физики) МФТИ 1958 года. По окончании института принял приглашение Герца Ицковича Будкера в только что созданный Институт ядерной физики в Новосибирске (ИЯФ). В 1988–2005 годах занимал должность заместителя директора ИЯФ. Руководил кафедрой физики плазмы Новосибирского государственного университета. Был председателем комиссии по борьбе с лженаукой и фальсификацией научных исследований. В 1997 году избран академиком РАН.
Эдуард Кругляков работал над созданием невозмущающих (бесконтактных) методов диагностики плазмы, в том числе разработкой и внедрением в эксперимент лазерных методов диагностики высокотемпературной плазмы. Занимался изучением коллективных эффектов в плазме, проводились на созданных под его руководством установках ГОЛ-1 (первая в СССР установка, на которой начинал отрабатываться процесс автоматизации термоядерного эксперимента) и ГОЛ-М.
На этих установках создавались первые системы управления, контроля параметров, высокочувствительные помехоустойчивые измерительные системы с высоким временным разрешением, первые аналого-цифровые преобразователи. Кругляков был удостоен Государственной премии СССР в 1986 году за работы, связанные с внедрением в эти исследования методов оптической интерферометрии, и за эксперименты по измерению электронной температуры и плотности в потоке быстро движущейся плазмы, впервые проведенные измерения нагрева плазмы за фронтом бесстолкновительной ударной волны.
Академик Кругляков — о лженауке: «Лженаука стала заметным явлением во многих странах мира. Ну а Россия, к сожалению, здесь среди лидеров. То, что происходило у нас в 90-е годы, не поддается описанию: возникло около 200 (!) различных «академий». И основная цель многих «академиков» — потрошить карманы наших граждан. К примеру, появилось абсолютно новое направление энергетики, не имеющее отношения к науке. Это так называемые вихревые генераторы. С их помощью якобы можно получать значительно больше энергии, чем затратили от сети. Самые наглые из них утверждают, что коэффициент полезного действия их генераторов — 1300%! Как вы считаете, если группа мошенников создает компанию, производит и продает вихревые генераторы, это организованная преступность или нет?»
Скончался на 79-м году жизни 6 ноября 2012 года в Новосибирске.
Проект к 80-летию Физтеха. Академики АН СССР и РАН — выпускники МФТИ.
